佛教十三经的说法，由来已久。杨仁山、梅吉庆以及中国佛学院都曾选有佛教十三经，所选经典大同小异。上述三家都选录的有：《金刚经》《维摩诘经》《法华经》《楞伽经》、《楞严经》，被两家选录的有：《心经》《胜鬘经》《观经》《无量寿经》《圆觉经》《金光明经》《梵网经》《坛经》。此外，《四十二章经》《佛遗教经》《解深密经》《八大人觉经》《大乘密严经》《地藏菩萨本愿经》《菩萨十住行道品经》《大毗卢遮那佛成佛神变加持经》为一家所选录。清代同治年间（一八六三年）吴坤修居士精心选编的《释氏十三经》，包括：华严部的《圆觉经》《梵网经》；方等部的《维摩诘所说经》《首楞严经》《楞伽经》、《无量寿经》《观无量寿经》；般若部的《金刚经》《心经》；法华部《妙法莲华经》（上下册）；小乘部的《四十二章经》《八大人觉经》《佛遗教经》。
著名佛教研究专家、南京大学博士生导师赖永海教授本着“对中国佛教影响最大、最能体现中国佛教基本精神”的原则，精心选择了如下十三部佛经，即《心经》《金刚经》《无量寿经》《圆觉经》《梵网经》《坛经》《楞严经》《解深密经》《维摩诘经》《楞伽经》《金光明经》《法华经》《四十二章经》，是为“佛教十三经”。